Wenn du Luftkühlung nutzt musst du dir beim Platz denke ich keine großen Gedanken machen. Problematisch wird es aber definitiv mit sehr langen Grafikkarten. Bei meiner HD4870, die die Stromanschlüsse nach hinten rausführt, ist das schon leicht eng aber noch gut machbar.
Den Festplattenlüfter kannst du zur Not auch umdrehen. In dem Fall sollte dann aber auch der hintere Lüfter nach draußen pusten. Das ganze ist wohl nur durch experimentieren zu ermitteln. Bei der Kombination würde man theoretisch wieder ein wenig der warmen Netzteil-Luft ins Gehäuse ziehen. Ich denke allerdings, dass das keinen nennenswerten Unterschied macht sofern da keine Killer-Hardware mit 1000W Verbrauch drin steckt
Wenn da einer Wasserkühlung reinkommt solltest du dir vorher sehr genau Gedanken machen wie du dir das vorstellst und entsprechend nachmessen und planen
Ein paar Impressionen: