Halte ich für recht wahrscheinlich, denn über das ATX Break Kabel kannst du den Rechner technisch betrachtet eigentlich nicht starten. Dazu müsste man das Signal auf Masse ziehen, was das aquaero aber nicht macht - es unterbricht ja nur die direkte Verbindung zwischen Netzteil und Mainboard.
Ich weiß aus dem OCN Forum, dass es da auch ein paar wenige User mit so einem Problem gab. Bei denen lag es definitiv am Board. Das lies sich auch nachweisen indem man einfach mal den Adapter entfernt und anderweitig den Strom getrennt hat. Danach ging der Rechner ebenfalls an sobald der Strom wieder da war.