Das Problem könnte eine chemische Reaktion sein, bei den cleaning Sets, die ich kenne, wird immer empfohlen mit mindestens 5l destilliertem Wasser zu spülen bevor man den Loop wieder befüllt.
Füllen und ablassen ist nicht durchspülen, da bleiben immer Reste im Loop, es sei denn Du zerlegst den Loop komplett.
Hier mal ein Beispiel zum Spülen des Systems:
https://www.youtube.com/watch?v=GqYQ-XnOPPI