bevor das hier noch weiter ausartet: truecrypt erstellt containerfiles vorgegebener größe, in denen die dateien verschlüsselt (AES = t3h be5t) enthalten sind. diese containerfiles kann man als laufwerke mounten und wie gewohnt damit arbeiten, aber auch als ganzes backuppen, per email austauschen, etc.
truecrypt ist übrigens open source und gerade im bereich sicherheit ist das ein killerkriterium.
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http://truecrypt.sourceforge.net/
edit: GnuPG wäre auch ne möglichkeit, fällt beim komfort aber weit zurück.
ich gehe übrigens mal davon aus, dass es sich hier um ein gesuch für windows handelt. unter linux kann man afaik bereits mit bordmitteln bereits verschlüsselte partitionen erstellen.