Also nur wegen einem Grafikkartenwechsel das Sytem neu aufzusetzen, halt ich für "mit Kanonen auf Spatzen" schießen. Wie Du schon selbst richtig festgestellt hast, ist das eine Menge Arbeit, das System wieder auf den alten Stand zu bringen und sollte der Weisheit letzter Schluss sein.
Hast Du den alten Treiber komplett entfernt oder einfach drüber installiert. Mich würde noch interessieren, welchen Treiber Du installiert hast? Den mitgelieferten oder die aktuelle Forceware? Versuchs auf alle Fälle mal mit der aktuellen Forceware von Nvidia! Such dir auf alle Fälle mal ein Tool im Netz, mit dem die Geforce Treiber komplett entfernen kannst!
Hier mal ein Link zu einem Entfernungstool für Treiberleichen...
http://www.tweakpc.de/?news_id=7159&rdf=1
Ansonsten finde ich deine bisherigen Maßnahmen nicht schlecht, die dafür sorgen dass Recourcenkonflikte ausgeschlossen werden können. Es wäre nicht schlecht, wenn die Graka sich den IrQ nicht teilen muesste.
Vielleicht solltest Du die Karte mal bei einem Freund einbauen, damit Du sicher gehst, dass sie i.O. ist.
Auch eine Inkompatibilität mit deinem System kann man nicht vollkommen ausschließen.
Mehr fällt mir erstmal nicht ein. Viel Spass und Erfolg beim Tüfteln!
Edit: Bios auf Default lassen würde ich nicht. Du solltest zumindest dem Bios sagen, dass eine AGP Karte gesteckt ist.
Wie ich anhand deines Boards sehen kann, hat diese eine integrierte Grafiklösung. Kann man das im Bios komplett abschalten? Wenn nicht, dann versuchs im Gerätemanager zu deaktivieren.....(Bios aktuell hoffe ich?)