Ich weiss zwar nicht genau was du mit einer CF Karte meinst, aber probier doch mal ein ganz normales Restore Programm. Ich habe mit "O&O Disk Recovery 4.0" mal gute Erfahrung gemacht...
Vorher evtl. mal DOS Eingabeaufforderung und "attrib Laufwerk:\*.* -r -a -s -h /s /d" eingeben, da soll so manche Datei wieder aufgetaucht sein...