Jabber ist so ausgelegt, dass das Roster (Gruppen und Kontakte) Server-seitig gespeichert werden. Wenn Miranda die nicht holt, würde ich da einfach einen Programmierfehler vermuten (bei der Gelegenheit werfe ich gleich mal ein Auge auf die Miranda-Site bzgl. der 0.5); entweder im Plugin oder, wenn das nicht aktualisiert wurde, in der API seitens Miranda, die es verwendet.
Das User-Directory ist dagegen, wie der Name vermuten lässt, eine Art gelbe Seiten, in der sich Benutzer optional eintragen und andere nach ihnen suchen können.
Edit: In den Miranda-Foren hat jemand ein
Verbindungs-Problem mit dem neueren Jabber-Plugin. Keine Verbindung, kein Roster. Kommt das für dich auch in Frage? Mal ohne TLS versucht? Und dann mal mitgeloggt/snifft?