Da gibt's je nach Konfiguration verschiedene Möglichkeiten. Am einfachsten wäre es natürlich, das schlicht über Benutzerrechte auf Dateisystemebene zu machen - falls Du NTFS benutzt!?
Du kannst auch mit Truecrypt (müsste Freeware sein) eine komplette Partition verschlüsseln und mit nem Kennwort schützen. Das ist im Betrieb von der Performance her praktisch nicht zu merken...
Gruß, M.