Ich kopier einfach immer den Profil-Ordner (ohne Cache). Dort sollte alles wichtige drin sein. Zumindest hatte ich bisher anschliessend nie Probleme wenn ich es wieder hineinkopiert habe.
Für eMails den Mail-Ordner sichern

Die Dateien aus dem Hauptordner sollte man zur Sicherheit auch noch speichern falls man daraus nochmal etwas braucht.