da man windows eigentlich spätestens alle 6 monate neu installieren sollte (ok, bei mir funzt es dank ausgefeiltem qualitätsmanagement meinerseits bei der auswahl der software immer noch

) und dabei auch altlasten von testweise installierten und wieder entfernten programmen, treibern, etc. los wird, empfiehlt sich eine komplette neuinstallation. wenn man die richtige software verwendet, wird man viel davon auch direkt weiterbenutzen können; eine neuinstallation dieser inkl. reinkopieren der gesicherten, alten configfiles ist mit etwas übung auch in weniger als einer minute erledigt. wenn man dann auf dinge wie logs und histories verzichtet, läuft das system u.u. auch gleich noch einen tick runder. zudem erzielt man mit der neuinstallation eine saubere aneinanderreihung der daten, so dass man sich eine defragmentierung sparen kann. (ok, bei nem am stück aufgespielten backup könnte das auch der fall sein...)
was das auslagern von programmen in andere verzeichnisse oder gar partitionen angeht, so habe ich damit keine besonders umwerfenden erfahrungen gemacht und alles wie gehabt in C:\Programme untergebracht. dann hat man alles da, wo man es erwartet (ok, von dll-massaker-programmen mal abgesehen).