Das nForce4 RAID ist in der Tat ein Software-RAID, und der Support unter Linux ist mehr als dürftig. Dafür kann man sich bei Nvidia bedanken, die so ziemlich den einzigen SATA - Controller ohne veröffentlichte Specs bauen...
Könnte also gut sein, dass Du das RAID platt machen müsstest, und (falls gewünscht) unter Linux ein reguläres Software-RAID bauen müsstest - aber generell keine gute Idee für eine Systemplatte, außer vielleicht RAID 1...