nein, dann funktioniert das prinzip der heatpipe nimmer (wenn das überhaupt welche sind...)

Nur mal vorweg: bringen tut sie im ungelüfteten Gehäuse nicht viel.
Im offenen Tower oder mit leichtem Lüfter-Luftzug kühlen die Heatpipes aber ordentlich (bei mir sank es von 39 auf 33°C ohne Kühler bei offenem Gehäuse).

Ob sich senkrecht der Kühleffekt verschlechtert weiss ich nicht, mit Aktivkühlung sicher nicht, passiv würde ich sagen schon, ist ja beim Radi genauso. Die Heatpipes haben ja nur den Effekt, die Hitze, welche an den Seiten der Platte entsteht, an die Umgebung abzugeben, was bei senkrechter Bauweise etwas behindert wird.