Kannst Du machen, allerdings sollte die Pumpe dann am besten auch auf dem Gehäuseboden stehen.
Optimaler weise sollte der Tube höher angebracht sein als die Pumpe und im Kreislauf direkt vor der Saugseite der Pumpe. Auf diese Weise kann die Pumpe immer nur luftblasenfreies Wasser ansaugen (vorausgesetzt es sprudelt im Tube nicht all zu sehr

), was das Befüllen und entlüften ungemein vereinfacht.
Dazu könnte man z.B. aus einen Stück Blech einen kleinen Sockel von wenigen cm Höhe zurechtbiegen und den Tube darauf stellen. Aber eigentlich sollte es auch reichen wenn die beiden auf gleicher Höhe sind.
Bei einem internen AT ist ein Fenster im Case aber Pflicht!