Der Tip mit dem Essig ist ne gute Sache.
Du solltest das System mit einer nicht zu hohen Essig-Konzentration 12-24 Std. durchlaufen lassen.
Danach versuche möglichst das komplette wasser aus der WaKü durch destiliertes wasser zuersetzen.
Nach weitern 12-24 Std. würde ich dann dieses wasser ebenfalles komplett erneuern, natürlich wieder mit destilierten wasser.
Nun solltest du keine allzu großen Probleme mit unsauberen Wasser haben.
Ist dein System jedoch zu stark verschmutzt und es kommt zu stärkerem Alkenwachstum (gerade bei offenen Systemen eine Gefahr) hilft nur ein:
schlammabsauger
;D