Im Grossen und Ganzen wird es funktionieren bis auf eine Kleinigkeit an der es dann auch scheitern würde: Windows wird nach wie vor versuchen den alten IDE-Controller anzusprechen da es dort ja schliesslich seine Systemplatte hat(te). Du würdest also direkt beim Hochfahren einen netten Bluescreen a la Inaccessible_Boot_Device bekommen.

Du musst Windows also schon im Vorfeld auf deine Umstellung vorbereiten. Du hast diesbezüglich eine KM da ich das icht alles abtippen werden ;D