Ich würde als Tool einfach Windows XP benutzen :
Format X: /fs:fat
Optional kann man noch /x dranhängen um das Laufwerk vom System quasi auszuklinken, was praktisch ist falls Windows meint, dass das Laufwerk momentan nicht formatiert werden kann.
Mit dem ebenfalls optionalen Parameter /a:xxx lässt sich noch die Grösse der Zuordnungseinheiten festlegen. Zulässige Werte für xxx sind 512, 1024, 2048, 4096, 8192, 16 kb, 32 kb und 64kb. Man belässt es am besten bei der Standardeinstellung, die automatisch genommen wird (also ohne /a).