Hi,
wenn Du es noch nicht gemacht hast, stell den Server auf passiven Modus und gib den dafür benötigten Portrange im Router frei.
Und schon fast am allerwichtigsten: Browser sind nur rudimentär für FTP brauchbar. Sag Deinen Usern, sie sollen einen vernünftigen FTP-Client benutzen wie z.B. FileZilla, FlashFXP oder UltraFXP. Der macht dann im Zweifelsfall einen Reconnect und gut ist.
Gruß
Kinyar