Du könntest den Ordner auch über die Rettungskonsole mittels Setup-CD löschen.
Ich würde an deiner Stelle aber noch ein Backup anfertigen weil manche Spy-Programme (sofern es denn eins ist) verankern sich so tief ins System, dass später nichts mehr läuft wenn man einfach den Ordner löscht.
Hast du mal Anti Spyware Tools drüberlaufen lassen?