Daraus schliesse ich, dass du die Defragmentierung von Windows verwendest, die so ergibig ist als ob man die Platte zwei drei mal mit der Hand schüttelt ;D
Probier es mal mit
O&O Defrag. Wähle am besten die Methode "Access". Dadurch werden die Daten nach der Häufigkeit der Zugriffe sortiert wobei alles notwendige für den Systemstart zwangsläufig nach aussen verlagert wird.
edit: noch ein Tipp. Lösche
vor dem Defragementieren den Cache deines Browsers sowie alle überflüssigen Dateien a la Temp-Ordner etc. von der Platte.