Hast du schon in Thunderbird die Ordner komprimiert, bzw. den Papierkorb geleert? Die Mails werden in den Datendateien nur als gelöscht markiert und nicht mehr angezeigt.
Mit >Datei>Ordner komprimieren werden die Mails endgültig gelöscht (siehe auch
http://www.markusbaumi.ch/tipps/thunderb…primieren.html)