Wenn die Datei sicher von A nach B soll, wäre SCP am sinnigsten (Secure Copy, getunnelte Direktübertragung über Internet mit großen, bösen RSA Authentisierungsschlüsseln). Ist ein Teil von SSH (Secure Shell), gibt's zB hier:
http://www.jfitz.com/tips/ssh_for_windows.html
http://winscp.sourceforge.net/
Der zugehörige Server wäre dann OpenSSH:
http://pigtail.net/LRP/printsrv/cygwin-sshd.html
Schöne deutsche Anleitung mit Link zum Server:
http://zedv.physik.fu-berlin.de/de/dokumentation/user/bilderbuch/sshd_win/